Được đánh giá là có những đóng góp quan trọng trong nhiều lĩnh vực của phát triển cộng đồng như y tế, giáo dục, môi trường... nhưng các tổ chức xã hội còn gặp phải không ít những vướng mắc về các thủ tục hành chính, dẫn đến những khó khăn trong việc nộp thuế cũng như tiếp cận nguồn viện trợ quốc tế.