Liên kết vùng Đông Nam Bộ cần được thực hiện để giải quyết từ những vấn đề đơn giản nhất như chia sẻ thông tin hoạt động, nhiệm vụ nghiên cứu, đầu tư nguồn lực,… Cục Công tác phía Nam Bộ Khoa học và Công nghệ (KH&CN) là đầu mối để xây dựng chương trình liên kết này.