Cụ thể, trong giai đoạn 2016-2020 sẽ xây dựng được ít nhất 1.200 mô hình ứng dụng, chuyển giao tiến bộ KH&CN hiệu quả, có quy mô phù hợp với vùng sinh thái của từng địa bàn nông thôn, miền núi, vùng dân tộc thiểu số, trong đó có ít nhất 30% số mô hình thực hiện ở miền núi, vùng dân tộc thiểu số; xây dựng được ít nhất 20% số mô hình liên kết ứng dụng khoa học và công nghệ theo chuỗi giá trị hàng hóa, tạo sinh kế cho người dân.
Trong giai đoạn 2021-2025, thêm ít nhất 1.000 mô hình được xây dựng; tăng tỷ lệ mô hình liên kết ứng dụng KH&CN theo chuỗi giá trị hàng hóa, các mô hình có quy mô sản xuất lớn, quy mô công nghiệp, gắn sản xuất nông nghiệp với công nghiệp chế biến.
Chương trình cũng đặt mục tiêu đến năm 2025 chuyển giao được ít nhất 3.000 lượt công nghệ mới, tiên tiến phù hợp với từng vùng, miền, thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội nông thôn, miền núi, vùng dân tộc thiểu số, ít nhất 20% trong số 1.500 lượt công nghệ được chuyển giao trong giai đoạn 2021-2025 phải là công nghệ cao; đào tạo, bồi dưỡng nâng cao năng lực quản lý và tổ chức triển khai dự án, năng lực ứng dụng và chuyển giao công nghệ cho ít nhất 1.500 cán bộ quản lý và khoảng 4.000 kỹ thuật viên cơ sở, tập huấn kỹ thuật cho khoảng 140.000 lượt nông dân.
Giai đoạn 2021-2025, có ít nhất 10 doanh nghiệp KH&CN hoạt động chuyển giao KH&CN phục vụ phát triển nông thôn, miền núi, vùng dân tộc thiểu số được hình thành từ chương trình.