Trong năm 2021, dù công việc giảng dạy và nghiên cứu bị ảnh hưởng khá nhiều vì COVID-19 nhưng trường Đại học Phenikaa vẫn có được 332 công bố quốc tế, trong đó khoảng 53% xuất bản trên các tạp chí thuộc nhóm Q1 và 17,5% xuất bản trên các tạp chí thuộc nhóm Q2, và 3 - 4 kết quả nghiên cứu ứng dụng trong thực tế.

Hầu hết các nhóm nghiên cứu mạnh của trường đều dẫn đầu về số lượng và chất lượng công bố như nhóm Phát triển và ứng dụng cảm biến nano của GS. TS Nguyễn Văn Hiếu 20 công bố, nhóm Quang điện tử và quang tử của GS. TS Phạm Thành Huy 11 công bố, nhóm Vật lý năng lượng cao và vũ trụ học của PGS. TS Phùng Văn Đồng 7 công bố.

Mặc dù đã vượt qua kết quả công bố của năm 2020 nhưng giáo sư Phạm Thành Huy, hiệu trưởng ĐH Phenikaa, thẳng thắn nhận xét, công bố năm 2021 vẫn còn chưa đạt được kỳ vọng mà nhà trường đặt ra bởi “mức tăng công bố một phần là do số lượng giảng viên của trường trong năm qua đã tăng đáng kể. Bên cạnh đó, cũng như đồng nghiệp ở nhiều cơ sở nghiên cứu và giảng dạy khác, công việc nghiên cứu của các giảng viên Phenikaa đã bị ảnh hưởng đáng kể, khó đến được phòng thí nghiệm, công việc hợp tác bị gián đoạn…”.

Tuy nhiên, nỗ lực nâng cao năng lực giảng dạy và nghiên cứu của trường ĐH Phenikaa đã có được kết quả đầu tiên: lần đầu tiên lọt vào bảng xếp hạng THE Impact Rankings. Đây là cơ sở để trường hướng tới mục tiêu có mặt trong Top 100 trường đại học tốt nhất châu Á trong 20 năm tới.