Sự ổn định về khí hậu của nhiều mùa trong năm ở khu vực thuộc núi Bà Đen là cơ sở để mãng cầu Bà Đen có thể ra hoa kết trái quanh năm không phụ thuộc vào mùa vụ.
Khu vực núi Bà Đen có khí hậu nhiệt đới gió mùa, có 2 mùa rõ rệt, mùa mưa từ tháng 5 đến tháng 11, mùa khô từ tháng 12 đến tháng 4 năm sau.Lượng mưa trung bình năm từ 1600mm – 2400mm, tập trung chủ yếu vào mùa mưa. Độ ẩm trung bình trong năm 80%, cao nhất: từ tháng 5 đến tháng 10 ẩm độ từ hơn 80% đến hơn 90% do lượng mưa nhiều, thấp nhất 68% - 69% vào tháng 01 - 02 do trời ít mây; ít mưa, nhiệt độ càng cao độ ẩm càng thấp.
Lượng bốc hơi cao chủ yếu vào mùa khô khoảng 1200mm đến 1500 mm do bức xạ mặt trời lớn làm tăng quá trình bốc hơi. Tuy nhiên do mực nước ngầm dồi dào và ổn định nên không ảnh hưởng nhiều đến quá trình sinh trưởng của cây trồng.
Cây mãng cầu Bà Đen có thể ra quả quanh năm là nhờ phần lớn vào khí hậu đặc biệt ở núi Bà Đen.
Tây Ninh và khu vực núi Bà Đen nằm sâu trong lục địa nhưng không gần thượng lưu đầu nguồn của các sông suối miền núi cao nên ít bị ảnh hưởng của lốc xoáy, mưa bão, hoàn lưu các cơn giông, bão, lũ lụt.
Nhiệt độ trung bình năm: 27,2 độC phân bố khá đều trong các tháng và tương đối ổn định trong nhiều năm. Chế độ bức xạ dồi dào, tổng tích ôn 9.500 – 10.0000C/năm.
Nhìn chung, khu vực này có khí hậu ôn hòa, ngày nhiều nắng nhưng cũng không quá gắt. Ban ngày trung bình có khoảng 7 giờ nắng/ngày với nhiệt độ tối cao trung bình 32,80C. Trong khoảng 10 năm qua tại khu vực núi Bà Đen, nhiệt độ tối cao tuyệt đối cũng chỉ là 37,50C, đảm bảo cho hoa mãng cầu phát triển, phát dục tốt, bộ lá quang hợp đầy đủ tích lũy dưỡng chất nuôi trái.
Thời gian tối ở khu vực núi Bà Đen khoảng từ 10 - 12 giờ tùy theo tiết Hạ chí hay Đông chí. Đêm kéo dài, nhiệt độ thấp kích thích hoặc thúc đẩy sự ra hoa, nhiệt độ tối thấp trung bình tháng là 23,60C. Vào đầu mùa khô tuy không có mưa nhưng nhiệt độ ban đêm vẫn thấp do ảnh hưởng của các khối không khí lạnh từ phía Bắc tràn vào.
Các tháng 12 và tháng 01, thậm chí ban đêm nhiệt độ thường dưới 200C. Trong vòng 10 năm qua, nhiệt độ tối thấp tuyệt đối là 13,00C vào ngày 01 tháng 12 năm 2006. Độ ẩm tối cao trung bình tháng là 90% lại gặp nhiệt độ thấp nên hầu như ngày nào cũng có sương.
Đêm về sáng trời nhiều sương, có khi thậm chí đến 6 – 7 giờ sáng, sương vẫn phủ quanh núi từ chân lên đỉnh núi. Trong 5 tháng cuối mùa mưa đầu mùa khô, độ ẩm tối cao trung bình từ tháng 11 đến tháng 3 năm sau. Đây là điều kiện lý tưởng cho sự phân hóa mầm hoa của mãng cầu ở Tây Ninh vào mùa khô.
Biên độ chênh lệch nhiệt độ ngày/đêm khu vực núi Bà Đen khoảng 8 – 10oC với sự chênh lệch nhiệt độ giữa các mùa trong năm khoảng 1,5 – 3oC. Sự ổn định về khí hậu của nhiều mùa trong năm là cơ sở để mãng cầu Bà Đen có thể ra hoa kết trái quanh năm không phụ thuộc vào mùa vụ.