Dù được coi là công cụ hữu hiệu giúp doanh nghiệp bảo vệ quyền sở hữu trí tuệ của mình từ sớm song nếu không có quy định kiểm soát, cơ chế phản đối đơn sở hữu công nghiệp có thể bị lợi dụng, kéo dài thời gian xử lý đơn và ảnh hưởng đến quyền lợi của những doanh nghiệp chân chính.