Tính từ thời gian thành lập đến nay, Viện đã triển khai thực hiện 20 nhiệm vụ KH&CN cấp quốc gia, 85 nhiệm vụ cấp bộ và 25 nhiệm vụ cấp cơ sở.

Cán bộ Viện kiểm tra Mô hình phát triển nông nghiệp trên đất cát ven biển Bắc trung bộ thuộc đề tài độc lập cấp Nhà nước: "Nghiên cứu phát triển bền vững hệ thống rừng phòng hộ tại dải ven biển Bắc Trung Bộ".

Bên cạnh đó, Viện đã triển khai trên 60 nhiệm vụ cấp tỉnh tại các địa phương như Điện Biên, Hà Giang, Tuyên Quang, Thái Nguyên, Bắc Giang, Vĩnh Phúc, Yên Bái, Thanh Hoá, Thừa Thiên Huế, Lạng Sơn, Cần Thơ....

Các nhiệm vụ này tập trung đánh giá tiềm lực KH&CN, nghiên cứu đề xuất các giải pháp phát triển KH&CN, phát triển các sản phẩm chủ lực của các vùng, các địa phương và ký hàng chục hợp đồng chuyển giao kỹ thuật tiên tiến để phát triển các sản phẩm nông nghiệp hàng hóa cho các vùng trong phạm vi cả nước.